（一）我国的税收体系正处于不断优化完善的过程中，从“营改增”开始各种税收政策，变化较快，包括增值税、企业所得税、个人所得税等，有统计表明从2016年3月到2018年11月国家相关部门只针对营改增就发布了114项文件，可见发布频率。而税收筹划是在这些文件的基础上开展的，时间差范围内有新的相关文件发布，也就意味着之前的纳税筹划方案可能会失去效用，如果企业继续实施，就会面临较大的税务风险。
（二）税收筹划方案的制定过程确实是依据税收规定及相关政策的，但具体的实施过程中有很多不确定性，方案中没有涉及的，是难以预料的。比如对以销售为主要业务活动的企业而言，纳税筹划往往是通过销售方式的组合实现的，不同的销售方式隐含的风险也是不同的进行税收筹划会遇到哪些风险，比如现销和赊销，如果在纳税筹划过程中过分关注节税的目的，而忽视到客户方的信用和市场发展形势，可能会给企业带来比节税金额更多的损失。
（三）税收筹划最终还是作用于企业的进行税收筹划会遇到哪些风险，如果企业经营现状稳定且有上升趋势，那么相对而言企业就可以选择节税金额大但风险程度高一点的纳税筹划方案，当然要在企业可承受的风险范围内，但是如果企业已经处于衰退阶段，仍然选择这样的税收筹划方案，可能会引发经营风险、财务风险、税务风险等，企业也会面临倒闭。
（四）在行业市场中，有的税收筹划人员过分依靠主观的经验，有的缺乏统筹思想，有的对市场行业不够了解，有的对政策变化不熟悉。总而言之，现在税收筹划人员的水平参差不齐，直接关系到税收筹划的质量和风险。
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